LUMC

Postdoctoraal onderzoeker – LUMC – Leiden

Jobid=8608781ce2e6 (0.0998)


Wat ga je doen?

Je analyseert en integreert multi-omics data uit voedingsinterventiestudies en cohortonderzoeken om beter te begrijpen hoe microbiële gemeenschappen bijdragen aan metabolisme en gezondheid. Daarbij richt je je op de functie van individuele microben, hun genen en eiwitten, en de interactie met de gastheer. Je werkt aan het verbeteren van analysetools en vertaalt je bevindingen samen met collega’s naar experimentele en toepasbare inzichten.

Je belangrijkste werkzaamheden zijn:

  • Ontwikkelen en toepassen van computationele methoden voor de integratieve analyse van (meta)genomische, metatranscriptomische, metabolomische en voedingsdata
  • Analyseren van microbiome-data uit dieetinterventiestudies en ontwikkelen van robuuste analysemethoden die rekening houden met longitudinale ontwerpen en verstorende factoren
  • Onderzoeken van microbe-host co-metabolisme binnen dieetinterventies en identificeren van nieuwe metabole routes en sleutelmicro-organismen
  • Bestuderen van microbiële glycobiologie, voorspellen van nieuwe CAZyme-loci en substraten, en bijdragen aan de experimentele validatie hiervan
  • Daarnaast werk je aan het onderhouden en doorontwikkelen van analysetools, zoals Cayman, en werk je nauw samen met experimentele onderzoekers om je bevindingen te toetsen in in-vitro en in-vivo modellen. Samen met specialisten in voeding draag je bij aan het ontwikkelen van nieuwe interventiestrategieën die het microbioom benutten om de menselijke gezondheid te verbeteren.


    Waar ga je werken?

    Je gaat werken bij het LUMC in Leiden, een academisch medisch centrum waar patiëntenzorg, onderzoek en onderwijs samenkomen. Binnen het LUMC ligt een sterke focus op vernieuwend onderzoek, waarbij fundamentele kennis over ziekteprocessen wordt vertaald naar toepassingen die de zorg van morgen verbeteren.

    Je maakt onderdeel uit van de recent opgerichte afdeling LUCID, waar onderzoekers uit microbiologie, parasitologie, immunologie en infectieziekten interdisciplinair samenwerken aan zowel fundamentele als translationele projecten. Je werkt binnen de Microbiome Systems Biology-groep, onder leiding van Georg Zeller, waar de interactie tussen het microbioom en de mens centraal staat.

    Binnen deze onderzoeksgroep worden geavanceerde sequencing- en imagingtechnieken gecombineerd met computationele analyses, statistiek en machine learning. Het doel is om beter te begrijpen hoe het microbioom samenwerkt met externe factoren zoals voeding en medicatie, hoe microben bijdragen aan ziekteprocessen en hoe gerichte beïnvloeding van het microbioom kan bijdragen aan herstel en betere behandelstrategieën. Je komt terecht in een internationaal en multidisciplinair team waar samenwerking, innovatie en inhoudelijke diepgang centraal staan.


    Wat neem je mee?

    Je bent nieuwsgierig en denkt creatief na over complexe vraagstukken, waarbij je eigenaarschap neemt over je werk. Je streeft naar impactvolle resultaten en zoekt actief de grenzen op van wat mogelijk is binnen microbiome- en voedingsonderzoek. Werken in een internationale en diverse omgeving geeft je energie, en je schakelt moeiteloos tussen zelfstandig werken en samenwerken met anderen. Je hebt een sterke interesse in het analyseren van complexe biomedische datasets en blijft jezelf ontwikkelen in innovatieve methoden en technieken.

    Verder beschik je over:

  • Je hebt een PhD in een biomedische richting, zoals computational biology, microbiology, biochemistry, nutritional science of een vergelijkbaar vakgebied
  • Je hebt aantoonbare ervaring met het analyseren van complexe datasets, bij voorkeur multi-omics data in R, en beschikt over een goede basis in statistische analyse
  • Je hebt expertise in de functionele analyse en interpretatie van microbiële data, bijvoorbeeld op het gebied van glycobiologie, microbe-dieet interacties, microbe-immuun interacties of microbe-host co-metabolisme
  • Je bent in staat om vanuit complexe data onderbouwde en toetsbare biologische hypothesen te formuleren

  • Wat bieden we jou?

    Door gezondheid gedreven; dat is onze missie. Dit geldt uiteraard niet alleen voor onze patiënten maar ook voor onze medewerkers. We streven naar een veilige, inclusieve en gelijkwaardige werkomgeving waarin talentontwikkeling en verbindend leiderschap centraal staan. Om te kunnen blijven leren en ontwikkelen bieden wij interne opleidingen en bijscholing aan. Daarnaast heb je recht op een eindejaarsuitkering (8,3%), vakantiegeld, fietsregeling, sportbudget, thuiswerkvergoeding en een uitstekende reiskostenregeling voor woon-werkverkeer. Ook ben je als medewerker van het LUMC aangesloten bij het ABP pensioenfonds. Dit betekent dat maar liefst 70% van je pensioenpremie betaald wordt door het LUMC en je daardoor netto meer salaris over houdt. Wel zo fijn!


    Waar staan wij voor?

    Als academisch medisch centrum streeft het LUMC naar een medewerkersbestand dat een goede afspiegeling is van de samenleving. Wij zetten ons in voor de hoogste kwaliteit op het gebied van gezondheidszorg, onderwijs en (internationaal) onderzoek, waarbij diverse perspectieven van cruciaal belang zijn. Duurzaamheid staat bij ons ook hoog in het vaandel: we zetten ons in voor een gezonde toekomst, niet alleen voor mensen, maar ook voor de planeet. In lijn met deze waarden willen we een creatieve en inspirerende werkplek zijn, waar het voor ons van essentieel belang is dat iedereen zich thuis, veilig en erkend voelt. Bij ons draait het om wie je bent en wat je bijdraagt, ongeacht je achtergrond. Samen werken wij aan een duurzame en inclusieve toekomst, zowel voor de mensen om ons heen als voor de wereld waarin we leven. Samen zijn wij LUMC.

    Meer informatie

  • Als gedreven postdoctoraal onderzoeker researcher bedraagt je salaris minimaal € ,- en maximaal € ,- bruto per maand (schaal 10, CAO UMC). Deze bedragen zijn op basis van een fulltime dienstverband.
  • Per 1 juli geldt een loonsverhoging van 3,5%, gevolgd door een aanvullende verhoging van 3,5% per 1 mei 2027.
  • De procedure bestaat uit meerdere fases, waaronder een eerste online gesprek, gevolgd door een uitgebreidere gespreksronde met leden van de Microbiome Systems Biology groep. Verdere informatie over de vervolgstappen in de sollicitatieprocedure volgt.
  • Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld. 
  • Lees hier meer

    Deel deze vacature:

    Deel deze vacature: